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新工具可定量分析RNA碱基编辑器活性—小柯机器人—科学网

发布时间:2019-11-27 01:59 来源:永利国际402娱乐官网

  以色列特拉维夫大学Eli Eisenberg团队在研究中取得进展。他们开发出对RNA腺苷脱氨酶(ADAR)的腺苷到肌苷RNA编辑活性的全基因组定量分析方法。该研究于10月21日在线发表于《自然方法学》。

  研究人员介绍,利用ADAR实现腺苷到肌苷(Ato-I)RNA编辑是一种常见的RNA修饰,可防止内源性双链RNA对先天免疫系统的错误激活。由于对ADAR在癌症和自身免疫性疾病中的作用越来越引起人们兴趣,以及试图利用ADAR酶进行RNA工程的研究,人们寻求了定量ADAR活性的方法。

  研究人员报道了Alu编辑索引(AEI),这是为此目的而设计的一种有力的且易于使用的计算工具。研究人员描述了它的特性,并证明了其相对于当前ADAR活性定量方法的优越性。AEI可用于在整个健康人类样本的大型数据集上绘制全局编辑图谱,并确定ADAR可能的调控因子,以及影响Alu编辑水平的未知因素。科学家在以后的ADAR活性比较研究中应考虑这些因素。

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